生物醫學科學家通常會經常檢查實驗室的細胞系是否被污染或貼錯標簽,但近日一項最新研究結果顯示,驗證細胞身份的任何努力或許就相當于進行細胞比較的參考標準一樣。
8月31日刊登在國際雜志Science Translational Medicine上的一項研究報告中,來自美國國家醫學科學研究所的研究人員通過研究指出,被廣泛用來研究腦癌的細胞系或許并不能匹配得上大約50年前創建的細胞系或據稱為源頭的腫瘤細胞;實際上,并沒有人能夠確切知道大多數細胞存儲庫所儲藏的細胞系的真正來源。
研究者Jon Lorsch說道,質疑你的假設并且盡可能地確保實驗中進行合適的控制,或許就能夠確保我們真的擁有那些我們所想的東西;來自美國科羅拉多大學丹佛分校( University of Colorado Denver )的研究者Christopher Korch指出,由于很少有細胞系曾經被驗證用來對抗原始的來源物質,因此這篇研究僅僅是冰山一角。
目前很多研究團隊都在盡力去解決被錯誤識別的細胞系,以求改善研究結果的可重復性,今年美國國立衛生研究院就開始要求經費申請人描述他們如何驗證實驗室中的細胞系,而且諸如Nature等雜志近來也開始要求作者在475個細胞系組成的數據庫中來檢查他們所使用的細胞系。
目前并沒有組織要求最新的研究能夠給出這類檔案資料,因此這就很難讓研究者進行標準的驗證了,此外研究者還發現,很多從事生命科學研究的科學家在其研究過程中并不會對細胞進行驗證。
被弄錯的身份
研究者提出疑問的細胞系—U87,就是1966年由瑞典烏普薩拉大學的研究者所建立的,研究者利用來自44歲患膠質母細胞瘤的女性機體的組織建立了U87細胞系,從那時開始U87就成為了腦癌研究的“重要工具”,至今研究者已經相繼發表了大約2000篇研究報告。對U87的研究熱情最初讓腫瘤生物學家Bengt Westermark非常疑惑,他表示,我并不理解為何人們要利用這么“無聊”的細胞來進行研究,20世紀70年代,作為一名畢業生,Westermark對8種不同的腦癌細胞系進行了研究,他認為利用U87并不能幫助研究,因為相比其它細胞而言,U87的生長非常緩慢。
多年以后,研究者Bengt Westermark基于U87開發出了處于自己的版本,而且目前由美國典型培養物保藏中心(ATCC)配給,研究者能夠觀察到U87細胞系的生長特性,而且U87明顯不同于其此前研究過的細胞系,因此Westermark決定開始研究進行一個正式的比較。很幸運的是,烏普薩拉大學目前仍然保存著能夠產生原始細胞系的腫瘤組織,這就能夠幫助研究者Westermark來驗證U87樣本的身份,隨后研究者利用DNA指紋技術發現,ATCC中的U87細胞系不同于烏普薩拉大學保存的細胞系,而且同烏普薩拉大學保存的任何一種類型的細胞系并不能匹配得上。
培養的改變
據ATCC科學技術總監Mindy Goldsborough表示,1982年ATCC獲得了來自紐約市斯隆凱特林癌癥紀念中心的U87細胞系,而該中心于1973年接收了來自烏普薩拉大學的細胞系;從那時候開始U87就進入了ATCC,U87細胞中有一個Y染色體,盡管實際上該細胞系被認為來自女性的機體,這或許就表明,細胞的混亂很有可能發生在斯隆凱特林癌癥紀念中心或細胞轉接的過程中。
鑒于最新的研究數據,目前ATCC開始計劃更新其目錄上U87細胞系的背景資料(研究者將其描述為來自于男性機體),但U87的真正來源至今仍然是個謎。Westermark的研究小組進行了一項基因特性的對比,結果表明,ATCC的細胞系很有可能來自于腦部腫瘤中,這或許是一個壞消息,因為該細胞系實際上并不是其應該成為的細胞系,但同時這或許又是一個好消息,因為其很有可能來自于膠質母細胞瘤中,這就意味著,對U87的研究或許就能夠深入探究腦癌生物學的機制,同時并不需要“扔掉”該細胞系。
如今很多科學家都認為是時候超越U87和其它經典細胞系了,而不管這些細胞來自哪里,因為從理論上來講用于細胞生長的培養條件就能夠改變細胞的生物學特性,研究者Westermark等人非常關心在生長培養基上能夠持續繁殖的新型細胞系,而且這些細胞系能夠確保遺傳和表觀遺傳學的穩定性,通過人類神經膠質瘤細胞培養生物樣本庫數據,烏普薩拉大學已經以較少的手續費將這類細胞提供給其它的研究者來使用了。
最后,來自紐約市威爾康奈爾腦瘤中心的神經腫瘤學家Howard Fine表示,如今我們已經能夠越來越多地理解我們此前使用的細胞系或許并不能很好地代表人類疾病的發病狀況,因此任何時候只要有人能夠駁倒U87細胞系的使用,我是非常高興的。
(科順生物www.azng.cn)